本项目将针对国家在保障区域水安全和生态安全、保护人民健康及建设和谐社会等方面的重大需求，开展湖泊蓝藻水华生态灾害形成机理及防治方面的基础研究，并最终回答以下三个关键科学问题：1）湖泊蓝藻水华主要衍生污染物的形成机理、迁移转化规律和毒理效应；2）蓝藻水华导致湖泊生态系统结构变化和功能退化的机理；3）蓝藻水华生态灾害评估及调控机理。 针对上述科学问题，本项目将以太湖生态系统为主要研究对象，选择巢湖和滇池为对比研究湖泊，以蓝藻水华污染物的产生、生态系统结构与功能的响应以及生态灾害的评估与调控为研究主线，围绕蓝藻水华形成后的主要过程，研究蓝藻水华衍生污染物的产生和归趋、主要污染物质的毒理效应及水质安全、蓝藻水华影响湖泊生态系统结构和功能的关键过程和途径。在此基础上，研究防治蓝藻水华生态灾害的新技术原理，建立我国湖泊蓝藻水华生态灾害的评估方法和指标体系，并提出相应的管理和调控对策。