本项目开展中国湖泊微生物多样性及其资源的系统调查，形成科学数据和调查报告共35个数据集。其中科学数据部分，对我国五大湖区共256个湖泊进行了调查采样，共1318个采样点，完成5022份物种多样性分析，获取微生物多样性基因5.61亿条，10925株菌的鉴定，509株微生物的分类地位及其抗逆特征数据，28个代表性湖泊的微生物宏基因组测序数据7.3TB，155324条功能基因及其抗逆基因注释1283条，首次建成中国湖泊微生物物种资源库和基因资源库、尤其是抗逆基因资源库。调查报告部分包含了项目的调查技术规范《湖泊微生物多样性及资源调查技术规范》以及项目野外调查报告《500株湖泊微生物的分类地位及其抗逆特征数据调查报告》、《中国湖泊微生物宏基因组学分析报告》与《中国湖泊微生物多样性及资源调查报告》。